Pieczęcią Naczelnika Miasta Warszawy jako przedstawiciela Rządu Narodowego posługiwali się kolejni naczelnicy stolicy w powstaniu styczniowym. Sygnowano nią rozkazy, korespondencję, zlecenia i odezwy ludności. „Ustawa o organizacji miasta stołecznego Warszawy” wydana przez Rząd Narodowy Karola Majewskiego 26 czerwca 1863 r. jasno określała, że Naczelnik Miasta stojący na czele Organizacji Miejskiej w stolicy powinien używać blankietów z napisem „Rząd Narodowy Naczelnik Miasta Warszawy”, opatrzonych „pieczęcią z herbem państwa i takim samym napisem”.

Zob. F. Ramotowska, Władze administracji narodowej Powstania Styczniowego 1859–1864, w: Archiwum Główne Akt Dawnych w Warszawie. Przewodnik po zasobie, t. II: Epoka porozbiorowa, red. F. Ramotowska, Warszawa 1998, s. 379.